Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPAL4Q0D2K0 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms