Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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