Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms