Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms