Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms