Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms