Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms