Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms