Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms