Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTRA4P83105 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms