Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HK3P52790 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HK3P52790 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HK3P52790 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HK3P52790 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HK3P52790 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HK3P52790 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HK3P52790 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HK3P52790 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HK3P52790 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HK3P52790 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HK3P52790 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HK3P52790 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HK3P52790 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HK3P52790 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HK3P52790 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HK3P52790 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HK3P52790 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HK3P52790 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HK3P52790 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HK3P52790 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HK3P52790 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HK3P52790 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HK3P52790 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HK3P52790 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HK3P52790 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HK3P52790 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HK3P52790 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HK3P52790 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HK3P52790 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HK3P52790 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HK3P52790 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HK3P52790 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HK3P52790 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HK3P52790 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HK3P52790 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HK3P52790 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HK3P52790 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HK3P52790 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HK3P52790 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HK3P52790 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HK3P52790 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HK3P52790 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HK3P52790 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HK3P52790 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HK3P52790 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HK3P52790 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HK3P52790 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HK3P52790 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HK3P52790 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HK3P52790 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HK3P52790 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HK3P52790 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HK3P52790 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HK3P52790 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HK3P52790 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HK3P52790 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HK3P52790 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HK3P52790 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HK3P52790 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HK3P52790 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HK3P52790 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HK3P52790 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HK3P52790 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HK3P52790 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HK3P52790 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HK3P52790 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HK3P52790 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HK3P52790 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HK3P52790 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HK3P52790 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HK3P52790 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HK3P52790 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HK3P52790 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HK3P52790 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HK3P52790 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HK3P52790 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HK3P52790 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HK3P52790 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HK3P52790 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HK3P52790 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HK3P52790 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HK3P52790 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HK3P52790 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HK3P52790 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HK3P52790 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HK3P52790 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HK3P52790 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HK3P52790 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HK3P52790 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HK3P52790 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HK3P52790 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HK3P52790 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HK3P52790 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HK3P52790 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HK3P52790 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HK3P52790 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HK3P52790 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HK3P52790 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HK3P52790 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms