Protein–RNA interactions for Protein: P50748

KNTC1, Kinetochore-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNTC1P50748 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KNTC1P50748 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KNTC1P50748 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KNTC1P50748 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KNTC1P50748 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KNTC1P50748 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KNTC1P50748 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KNTC1P50748 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KNTC1P50748 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KNTC1P50748 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KNTC1P50748 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KNTC1P50748 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KNTC1P50748 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KNTC1P50748 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KNTC1P50748 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KNTC1P50748 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KNTC1P50748 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KNTC1P50748 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KNTC1P50748 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KNTC1P50748 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KNTC1P50748 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KNTC1P50748 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KNTC1P50748 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KNTC1P50748 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KNTC1P50748 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KNTC1P50748 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KNTC1P50748 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KNTC1P50748 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KNTC1P50748 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KNTC1P50748 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KNTC1P50748 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KNTC1P50748 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KNTC1P50748 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KNTC1P50748 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KNTC1P50748 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KNTC1P50748 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KNTC1P50748 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KNTC1P50748 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KNTC1P50748 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KNTC1P50748 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KNTC1P50748 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KNTC1P50748 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KNTC1P50748 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KNTC1P50748 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KNTC1P50748 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KNTC1P50748 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KNTC1P50748 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KNTC1P50748 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KNTC1P50748 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KNTC1P50748 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KNTC1P50748 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KNTC1P50748 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KNTC1P50748 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KNTC1P50748 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KNTC1P50748 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KNTC1P50748 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KNTC1P50748 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KNTC1P50748 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KNTC1P50748 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KNTC1P50748 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KNTC1P50748 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KNTC1P50748 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KNTC1P50748 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KNTC1P50748 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KNTC1P50748 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KNTC1P50748 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KNTC1P50748 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KNTC1P50748 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KNTC1P50748 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KNTC1P50748 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KNTC1P50748 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KNTC1P50748 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KNTC1P50748 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KNTC1P50748 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
KNTC1P50748 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KNTC1P50748 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KNTC1P50748 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KNTC1P50748 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
KNTC1P50748 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KNTC1P50748 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KNTC1P50748 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
KNTC1P50748 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KNTC1P50748 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KNTC1P50748 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KNTC1P50748 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KNTC1P50748 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KNTC1P50748 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KNTC1P50748 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KNTC1P50748 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KNTC1P50748 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KNTC1P50748 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KNTC1P50748 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KNTC1P50748 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KNTC1P50748 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KNTC1P50748 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KNTC1P50748 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KNTC1P50748 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KNTC1P50748 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KNTC1P50748 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KNTC1P50748 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms