Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GRIA4P48058 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms