Protein–RNA interactions for Protein: P43357

MAGEA3, Melanoma-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA3P43357 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEA3P43357 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms