Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC1A1P43005 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC1A1P43005 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC1A1P43005 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC1A1P43005 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC1A1P43005 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC1A1P43005 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178.2 ms