Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA2P42262 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms