Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms