Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms