Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA3P35244 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA3P35244 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA3P35244 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA3P35244 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA3P35244 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA3P35244 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA3P35244 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA3P35244 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA3P35244 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA3P35244 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA3P35244 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA3P35244 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA3P35244 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA3P35244 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA3P35244 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA3P35244 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA3P35244 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA3P35244 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA3P35244 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA3P35244 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA3P35244 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA3P35244 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA3P35244 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA3P35244 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA3P35244 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA3P35244 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA3P35244 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA3P35244 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA3P35244 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA3P35244 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA3P35244 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA3P35244 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA3P35244 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA3P35244 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA3P35244 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA3P35244 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA3P35244 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA3P35244 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA3P35244 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA3P35244 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA3P35244 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA3P35244 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA3P35244 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA3P35244 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA3P35244 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA3P35244 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA3P35244 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA3P35244 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA3P35244 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA3P35244 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA3P35244 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA3P35244 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA3P35244 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA3P35244 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA3P35244 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA3P35244 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA3P35244 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA3P35244 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA3P35244 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA3P35244 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA3P35244 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA3P35244 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA3P35244 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA3P35244 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA3P35244 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA3P35244 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA3P35244 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA3P35244 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA3P35244 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA3P35244 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA3P35244 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA3P35244 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA3P35244 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA3P35244 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA3P35244 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA3P35244 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA3P35244 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA3P35244 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA3P35244 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA3P35244 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA3P35244 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA3P35244 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA3P35244 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA3P35244 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA3P35244 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA3P35244 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA3P35244 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA3P35244 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA3P35244 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA3P35244 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA3P35244 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA3P35244 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPA3P35244 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPA3P35244 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPA3P35244 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPA3P35244 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPA3P35244 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPA3P35244 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPA3P35244 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms