Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms