Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPS1P31327 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPS1P31327 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPS1P31327 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPS1P31327 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPS1P31327 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPS1P31327 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPS1P31327 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPS1P31327 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CPS1P31327 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPS1P31327 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPS1P31327 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPS1P31327 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPS1P31327 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPS1P31327 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPS1P31327 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPS1P31327 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CPS1P31327 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPS1P31327 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPS1P31327 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPS1P31327 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPS1P31327 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPS1P31327 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPS1P31327 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CPS1P31327 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPS1P31327 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPS1P31327 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPS1P31327 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPS1P31327 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPS1P31327 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPS1P31327 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPS1P31327 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CPS1P31327 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPS1P31327 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CPS1P31327 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPS1P31327 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPS1P31327 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPS1P31327 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPS1P31327 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPS1P31327 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPS1P31327 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPS1P31327 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPS1P31327 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPS1P31327 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPS1P31327 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPS1P31327 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPS1P31327 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPS1P31327 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPS1P31327 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPS1P31327 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPS1P31327 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPS1P31327 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPS1P31327 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPS1P31327 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPS1P31327 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPS1P31327 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPS1P31327 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPS1P31327 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPS1P31327 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPS1P31327 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPS1P31327 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CPS1P31327 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPS1P31327 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CPS1P31327 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CPS1P31327 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPS1P31327 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPS1P31327 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPS1P31327 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CPS1P31327 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPS1P31327 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPS1P31327 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPS1P31327 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPS1P31327 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CPS1P31327 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CPS1P31327 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPS1P31327 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPS1P31327 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CPS1P31327 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPS1P31327 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CPS1P31327 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPS1P31327 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPS1P31327 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPS1P31327 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CPS1P31327 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CPS1P31327 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CPS1P31327 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CPS1P31327 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CPS1P31327 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPS1P31327 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPS1P31327 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CPS1P31327 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CPS1P31327 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPS1P31327 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CPS1P31327 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPS1P31327 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CPS1P31327 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CPS1P31327 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CPS1P31327 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPS1P31327 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPS1P31327 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms