Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP1P29466 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP1P29466 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP1P29466 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP1P29466 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP1P29466 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP1P29466 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP1P29466 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP1P29466 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP1P29466 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP1P29466 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP1P29466 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP1P29466 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP1P29466 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP1P29466 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP1P29466 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP1P29466 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP1P29466 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP1P29466 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP1P29466 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP1P29466 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP1P29466 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP1P29466 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP1P29466 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP1P29466 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP1P29466 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP1P29466 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP1P29466 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP1P29466 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP1P29466 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP1P29466 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP1P29466 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP1P29466 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP1P29466 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP1P29466 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP1P29466 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP1P29466 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP1P29466 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP1P29466 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP1P29466 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP1P29466 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP1P29466 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP1P29466 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP1P29466 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP1P29466 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP1P29466 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP1P29466 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP1P29466 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP1P29466 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP1P29466 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP1P29466 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP1P29466 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP1P29466 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP1P29466 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP1P29466 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP1P29466 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP1P29466 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP1P29466 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP1P29466 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP1P29466 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP1P29466 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP1P29466 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP1P29466 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP1P29466 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP1P29466 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP1P29466 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP1P29466 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP1P29466 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP1P29466 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP1P29466 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP1P29466 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP1P29466 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP1P29466 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP1P29466 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP1P29466 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP1P29466 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP1P29466 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP1P29466 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP1P29466 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP1P29466 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP1P29466 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP1P29466 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP1P29466 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP1P29466 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP1P29466 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP1P29466 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP1P29466 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP1P29466 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP1P29466 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP1P29466 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP1P29466 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP1P29466 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP1P29466 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP1P29466 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP1P29466 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP1P29466 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP1P29466 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP1P29466 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP1P29466 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP1P29466 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms