Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PLNP26678 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
PLNP26678 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
PLNP26678 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
PLNP26678 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PLNP26678 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
PLNP26678 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
PLNP26678 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
PLNP26678 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
PLNP26678 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PLNP26678 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
PLNP26678 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PLNP26678 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PLNP26678 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PLNP26678 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PLNP26678 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PLNP26678 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PLNP26678 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PLNP26678 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PLNP26678 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PLNP26678 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PLNP26678 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PLNP26678 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PLNP26678 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PLNP26678 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PLNP26678 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PLNP26678 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PLNP26678 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PLNP26678 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PLNP26678 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PLNP26678 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PLNP26678 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PLNP26678 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PLNP26678 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PLNP26678 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PLNP26678 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PLNP26678 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PLNP26678 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PLNP26678 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PLNP26678 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PLNP26678 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PLNP26678 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PLNP26678 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PLNP26678 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PLNP26678 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PLNP26678 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PLNP26678 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PLNP26678 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PLNP26678 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PLNP26678 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PLNP26678 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PLNP26678 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PLNP26678 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PLNP26678 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PLNP26678 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PLNP26678 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms