Protein–RNA interactions for Protein: P21953

BCKDHB, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHBP21953 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHBP21953 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.9 ms