Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SDSP20132 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SDSP20132 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SDSP20132 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SDSP20132 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SDSP20132 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SDSP20132 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SDSP20132 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SDSP20132 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SDSP20132 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SDSP20132 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SDSP20132 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SDSP20132 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SDSP20132 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SDSP20132 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SDSP20132 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SDSP20132 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SDSP20132 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SDSP20132 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SDSP20132 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SDSP20132 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SDSP20132 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SDSP20132 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SDSP20132 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SDSP20132 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SDSP20132 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SDSP20132 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SDSP20132 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SDSP20132 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SDSP20132 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SDSP20132 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SDSP20132 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SDSP20132 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SDSP20132 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SDSP20132 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SDSP20132 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SDSP20132 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SDSP20132 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SDSP20132 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SDSP20132 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SDSP20132 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SDSP20132 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SDSP20132 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SDSP20132 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SDSP20132 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SDSP20132 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SDSP20132 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SDSP20132 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SDSP20132 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SDSP20132 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SDSP20132 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SDSP20132 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SDSP20132 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SDSP20132 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SDSP20132 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SDSP20132 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SDSP20132 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SDSP20132 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SDSP20132 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SDSP20132 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SDSP20132 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SDSP20132 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SDSP20132 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SDSP20132 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SDSP20132 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SDSP20132 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SDSP20132 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SDSP20132 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SDSP20132 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SDSP20132 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SDSP20132 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SDSP20132 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SDSP20132 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SDSP20132 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SDSP20132 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SDSP20132 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SDSP20132 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SDSP20132 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SDSP20132 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SDSP20132 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SDSP20132 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SDSP20132 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SDSP20132 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SDSP20132 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SDSP20132 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SDSP20132 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SDSP20132 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SDSP20132 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SDSP20132 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SDSP20132 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SDSP20132 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SDSP20132 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SDSP20132 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SDSP20132 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SDSP20132 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SDSP20132 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SDSP20132 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SDSP20132 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SDSP20132 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SDSP20132 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms