Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B1P20020 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms