Protein–RNA interactions for Protein: P18428

LBP, Lipopolysaccharide-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBPP18428 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LBPP18428 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LBPP18428 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LBPP18428 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LBPP18428 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LBPP18428 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LBPP18428 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LBPP18428 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LBPP18428 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LBPP18428 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LBPP18428 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LBPP18428 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LBPP18428 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LBPP18428 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LBPP18428 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LBPP18428 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LBPP18428 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LBPP18428 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LBPP18428 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LBPP18428 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LBPP18428 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LBPP18428 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LBPP18428 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LBPP18428 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LBPP18428 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LBPP18428 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LBPP18428 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LBPP18428 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LBPP18428 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LBPP18428 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LBPP18428 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LBPP18428 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LBPP18428 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LBPP18428 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LBPP18428 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LBPP18428 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LBPP18428 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LBPP18428 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LBPP18428 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LBPP18428 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LBPP18428 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LBPP18428 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LBPP18428 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LBPP18428 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LBPP18428 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LBPP18428 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LBPP18428 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LBPP18428 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LBPP18428 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LBPP18428 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LBPP18428 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LBPP18428 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LBPP18428 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LBPP18428 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LBPP18428 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LBPP18428 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LBPP18428 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LBPP18428 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LBPP18428 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LBPP18428 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LBPP18428 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LBPP18428 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LBPP18428 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LBPP18428 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LBPP18428 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LBPP18428 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LBPP18428 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LBPP18428 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LBPP18428 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LBPP18428 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LBPP18428 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LBPP18428 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LBPP18428 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LBPP18428 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LBPP18428 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LBPP18428 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LBPP18428 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LBPP18428 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LBPP18428 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LBPP18428 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LBPP18428 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LBPP18428 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LBPP18428 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LBPP18428 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LBPP18428 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LBPP18428 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LBPP18428 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LBPP18428 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LBPP18428 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LBPP18428 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LBPP18428 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LBPP18428 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LBPP18428 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LBPP18428 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LBPP18428 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LBPP18428 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LBPP18428 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LBPP18428 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LBPP18428 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LBPP18428 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms