Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms