Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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SFTPCP11686 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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SFTPCP11686 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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SFTPCP11686 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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SFTPCP11686 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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SFTPCP11686 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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SFTPCP11686 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SFTPCP11686 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SFTPCP11686 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SFTPCP11686 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
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SFTPCP11686 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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SFTPCP11686 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SFTPCP11686 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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SFTPCP11686 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SFTPCP11686 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SFTPCP11686 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SFTPCP11686 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SFTPCP11686 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SFTPCP11686 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SFTPCP11686 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SFTPCP11686 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SFTPCP11686 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SFTPCP11686 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SFTPCP11686 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SFTPCP11686 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SFTPCP11686 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SFTPCP11686 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SFTPCP11686 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SFTPCP11686 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SFTPCP11686 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SFTPCP11686 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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