Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RGPD2P0DJD1 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RGPD2P0DJD1 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RGPD2P0DJD1 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RGPD2P0DJD1 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RGPD2P0DJD1 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RGPD2P0DJD1 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RGPD2P0DJD1 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RGPD2P0DJD1 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RGPD2P0DJD1 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RGPD2P0DJD1 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RGPD2P0DJD1 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RGPD2P0DJD1 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RGPD2P0DJD1 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RGPD2P0DJD1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RGPD2P0DJD1 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RGPD2P0DJD1 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RGPD2P0DJD1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RGPD2P0DJD1 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RGPD2P0DJD1 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RGPD2P0DJD1 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RGPD2P0DJD1 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RGPD2P0DJD1 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RGPD2P0DJD1 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RGPD2P0DJD1 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RGPD2P0DJD1 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RGPD2P0DJD1 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RGPD2P0DJD1 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RGPD2P0DJD1 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RGPD2P0DJD1 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RGPD2P0DJD1 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms