Protein–RNA interactions for Protein: P04259

KRT6B, Keratin, type II cytoskeletal 6B, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6BP04259 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms