Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR1AO95602 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms