Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F6O75461 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F6O75461 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F6O75461 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F6O75461 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F6O75461 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F6O75461 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F6O75461 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F6O75461 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F6O75461 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F6O75461 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F6O75461 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F6O75461 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F6O75461 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F6O75461 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F6O75461 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F6O75461 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F6O75461 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F6O75461 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F6O75461 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F6O75461 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F6O75461 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F6O75461 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F6O75461 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F6O75461 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F6O75461 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F6O75461 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F6O75461 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F6O75461 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F6O75461 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F6O75461 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F6O75461 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F6O75461 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F6O75461 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F6O75461 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F6O75461 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F6O75461 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F6O75461 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F6O75461 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F6O75461 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F6O75461 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F6O75461 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F6O75461 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F6O75461 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F6O75461 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F6O75461 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F6O75461 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F6O75461 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F6O75461 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F6O75461 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F6O75461 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F6O75461 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F6O75461 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F6O75461 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F6O75461 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F6O75461 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F6O75461 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F6O75461 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F6O75461 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F6O75461 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F6O75461 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F6O75461 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F6O75461 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F6O75461 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F6O75461 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F6O75461 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F6O75461 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F6O75461 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F6O75461 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F6O75461 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F6O75461 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F6O75461 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F6O75461 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F6O75461 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F6O75461 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F6O75461 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F6O75461 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F6O75461 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F6O75461 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F6O75461 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F6O75461 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F6O75461 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F6O75461 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F6O75461 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F6O75461 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F6O75461 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F6O75461 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F6O75461 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F6O75461 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F6O75461 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F6O75461 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F6O75461 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F6O75461 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F6O75461 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F6O75461 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F6O75461 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F6O75461 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F6O75461 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F6O75461 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F6O75461 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms