Protein–RNA interactions for Protein: O60664

PLIN3, Perilipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN3O60664 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PLIN3O60664 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLIN3O60664 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLIN3O60664 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLIN3O60664 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLIN3O60664 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLIN3O60664 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLIN3O60664 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLIN3O60664 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLIN3O60664 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLIN3O60664 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLIN3O60664 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLIN3O60664 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLIN3O60664 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLIN3O60664 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLIN3O60664 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLIN3O60664 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLIN3O60664 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLIN3O60664 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLIN3O60664 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLIN3O60664 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLIN3O60664 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLIN3O60664 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLIN3O60664 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLIN3O60664 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLIN3O60664 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLIN3O60664 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLIN3O60664 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLIN3O60664 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLIN3O60664 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLIN3O60664 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLIN3O60664 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLIN3O60664 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLIN3O60664 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLIN3O60664 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLIN3O60664 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLIN3O60664 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLIN3O60664 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLIN3O60664 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLIN3O60664 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLIN3O60664 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLIN3O60664 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PLIN3O60664 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PLIN3O60664 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLIN3O60664 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PLIN3O60664 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PLIN3O60664 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PLIN3O60664 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PLIN3O60664 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PLIN3O60664 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PLIN3O60664 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PLIN3O60664 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PLIN3O60664 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PLIN3O60664 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PLIN3O60664 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PLIN3O60664 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PLIN3O60664 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PLIN3O60664 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLIN3O60664 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLIN3O60664 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLIN3O60664 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLIN3O60664 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLIN3O60664 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLIN3O60664 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PLIN3O60664 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLIN3O60664 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLIN3O60664 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLIN3O60664 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLIN3O60664 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLIN3O60664 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLIN3O60664 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLIN3O60664 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLIN3O60664 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLIN3O60664 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLIN3O60664 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLIN3O60664 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLIN3O60664 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLIN3O60664 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLIN3O60664 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PLIN3O60664 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PLIN3O60664 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLIN3O60664 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLIN3O60664 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLIN3O60664 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLIN3O60664 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLIN3O60664 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLIN3O60664 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PLIN3O60664 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PLIN3O60664 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLIN3O60664 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLIN3O60664 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLIN3O60664 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLIN3O60664 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLIN3O60664 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLIN3O60664 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLIN3O60664 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLIN3O60664 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLIN3O60664 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLIN3O60664 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLIN3O60664 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms