Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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LRRTM2O43300 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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LRRTM2O43300 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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LRRTM2O43300 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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LRRTM2O43300 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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LRRTM2O43300 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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LRRTM2O43300 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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LRRTM2O43300 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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LRRTM2O43300 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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LRRTM2O43300 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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