Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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C9orf172C9J069 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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C9orf172C9J069 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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C9orf172C9J069 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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