Protein–RNA interactions for Protein: B4DJY2

TMEM233, Transmembrane protein 233, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM233B4DJY2 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM233B4DJY2 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms