Protein–RNA interactions for Protein: A6XGL0

YJEFN3, YjeF N-terminal domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YJEFN3A6XGL0 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
YJEFN3A6XGL0 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms