Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms