Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X2

PIAS3, E3 SUMO-protein ligase PIAS3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIAS3Q9Y6X2 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms