Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C2

TCAF1, TRPM8 channel-associated factor 1, humanhuman

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Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF1Q9Y4C2 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
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