Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CAB39Q9Y376 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CAB39Q9Y376 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CAB39Q9Y376 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CAB39Q9Y376 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CAB39Q9Y376 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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CAB39Q9Y376 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CAB39Q9Y376 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CAB39Q9Y376 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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