Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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RABGEF1Q9UJ41 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RABGEF1Q9UJ41 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RABGEF1Q9UJ41 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RABGEF1Q9UJ41 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RABGEF1Q9UJ41 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RABGEF1Q9UJ41 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RABGEF1Q9UJ41 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RABGEF1Q9UJ41 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RABGEF1Q9UJ41 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RABGEF1Q9UJ41 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RABGEF1Q9UJ41 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RABGEF1Q9UJ41 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RABGEF1Q9UJ41 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RABGEF1Q9UJ41 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RABGEF1Q9UJ41 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RABGEF1Q9UJ41 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RABGEF1Q9UJ41 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RABGEF1Q9UJ41 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RABGEF1Q9UJ41 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RABGEF1Q9UJ41 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RABGEF1Q9UJ41 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RABGEF1Q9UJ41 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RABGEF1Q9UJ41 AL603841.1-201ENST00000430516 664 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RABGEF1Q9UJ41 GOSR1-204ENST00000451249 1231 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RABGEF1Q9UJ41 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RABGEF1Q9UJ41 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RABGEF1Q9UJ41 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RABGEF1Q9UJ41 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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RABGEF1Q9UJ41 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
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RABGEF1Q9UJ41 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RABGEF1Q9UJ41 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RABGEF1Q9UJ41 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RABGEF1Q9UJ41 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
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RABGEF1Q9UJ41 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RABGEF1Q9UJ41 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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RABGEF1Q9UJ41 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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RABGEF1Q9UJ41 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RABGEF1Q9UJ41 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RABGEF1Q9UJ41 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RABGEF1Q9UJ41 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RABGEF1Q9UJ41 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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RABGEF1Q9UJ41 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RABGEF1Q9UJ41 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RABGEF1Q9UJ41 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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RABGEF1Q9UJ41 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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RABGEF1Q9UJ41 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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RABGEF1Q9UJ41 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RABGEF1Q9UJ41 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RABGEF1Q9UJ41 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RABGEF1Q9UJ41 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RABGEF1Q9UJ41 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RABGEF1Q9UJ41 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RABGEF1Q9UJ41 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RABGEF1Q9UJ41 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RABGEF1Q9UJ41 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RABGEF1Q9UJ41 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RABGEF1Q9UJ41 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RABGEF1Q9UJ41 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RABGEF1Q9UJ41 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RABGEF1Q9UJ41 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RABGEF1Q9UJ41 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RABGEF1Q9UJ41 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RABGEF1Q9UJ41 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RABGEF1Q9UJ41 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RABGEF1Q9UJ41 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RABGEF1Q9UJ41 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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