Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN11AQ9UI33 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCN11AQ9UI33 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCN11AQ9UI33 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCN11AQ9UI33 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SCN11AQ9UI33 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCN11AQ9UI33 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCN11AQ9UI33 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCN11AQ9UI33 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCN11AQ9UI33 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SCN11AQ9UI33 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCN11AQ9UI33 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SCN11AQ9UI33 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCN11AQ9UI33 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SCN11AQ9UI33 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCN11AQ9UI33 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCN11AQ9UI33 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN11AQ9UI33 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN11AQ9UI33 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN11AQ9UI33 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN11AQ9UI33 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN11AQ9UI33 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN11AQ9UI33 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN11AQ9UI33 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN11AQ9UI33 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN11AQ9UI33 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN11AQ9UI33 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN11AQ9UI33 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN11AQ9UI33 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN11AQ9UI33 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN11AQ9UI33 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN11AQ9UI33 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN11AQ9UI33 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN11AQ9UI33 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN11AQ9UI33 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN11AQ9UI33 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN11AQ9UI33 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN11AQ9UI33 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN11AQ9UI33 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN11AQ9UI33 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN11AQ9UI33 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN11AQ9UI33 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN11AQ9UI33 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN11AQ9UI33 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN11AQ9UI33 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN11AQ9UI33 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN11AQ9UI33 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN11AQ9UI33 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN11AQ9UI33 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN11AQ9UI33 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN11AQ9UI33 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN11AQ9UI33 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN11AQ9UI33 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN11AQ9UI33 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN11AQ9UI33 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN11AQ9UI33 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN11AQ9UI33 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN11AQ9UI33 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN11AQ9UI33 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN11AQ9UI33 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN11AQ9UI33 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN11AQ9UI33 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN11AQ9UI33 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN11AQ9UI33 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN11AQ9UI33 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms