Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms