Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms