Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms