Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD5Q9P267 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD5Q9P267 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD5Q9P267 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD5Q9P267 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD5Q9P267 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD5Q9P267 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD5Q9P267 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD5Q9P267 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD5Q9P267 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD5Q9P267 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD5Q9P267 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD5Q9P267 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD5Q9P267 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD5Q9P267 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD5Q9P267 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD5Q9P267 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD5Q9P267 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD5Q9P267 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD5Q9P267 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD5Q9P267 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD5Q9P267 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD5Q9P267 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MBD5Q9P267 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MBD5Q9P267 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MBD5Q9P267 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MBD5Q9P267 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MBD5Q9P267 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MBD5Q9P267 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MBD5Q9P267 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MBD5Q9P267 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MBD5Q9P267 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
MBD5Q9P267 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MBD5Q9P267 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MBD5Q9P267 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MBD5Q9P267 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms