Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CCDC180Q9P1Z9 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC31.64■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC31.64■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms