Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG0

CNTLN, Centlein, humanhuman

Predictions only

Length 1,405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTLNQ9NXG0 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms